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En 1859, après plus de vingt ans de travail, Darwin publie L’origine des espèces. La brève introduction s’ouvre par une allusion aux informations acquises pendant le voyage du Beagle, sur la distribution géographique et sur la géologie, qui «semblent jeter quelque lumière sur l’origine des espèces, ce mystère des mystères».
Objectif de l’ouvrage : «élucider quels sont les moyens de modification et de coadaptation». L’étude attentive des animaux domestiques et des plantes cultivées y est présentée comme le meilleur champ de recherches pour résoudre «cet obscur problème».
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